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南方医科大学研究生院成立于2016年，前身系南方医科大学研究生学院、第一军医大学研究生处。我校前身为中国人民解放军第一军医大学，创建于1951年，1979年被确定为全国重点大学，2004年8月整体移交广东省，更名为南方医科大学，是广东省唯一一所由国家教育部、国家卫计委与广东省共建的医科大学，也是广东省高水平大学重点建设高校中唯一的医学院校。

研究生院是学校学位与研究生教育的主管机构，下设6个办公室，分别是：综合办公室、招生办公室、培养办公室、学位办公室、医师规培办公室和研究生管理办公室。研究生院将秉承“博学笃行 尚德济世”的校训精神，打造团结奋进的研究生教育管理团队，努力为研究生教育各项工作服务。